Kristalizacija - priprema uzoraka za pokuse rendgenske difrakcije, određivanje simetrije kristala. Prikupljanje difrakcijskih podataka. Procjena intenziteta difrakcije rendgenskih zraka. Rješavanje faznog problema. Fourierova sinteza. Interpretacija mapa elektronske gustoće, grubi model. Usavršavanje grubog modela i prilagođavanje izmjerenim intenzitetima. Primarna, sekundarna, tercijarna struktura makromolekula. Strukturna evaluacija modela i prepoznavanje biološke funkcije proteina korištenjem baza podataka i strukturalne bioinformatike (Cambridge Structural Database, Protein Data Bank, SwissProt, Phyre i dr.).
|
- OBVEZNA LITERATURA:
Protein Crystallography, Methods and Protocols, Eds: A. Wlodawer, Z. Dauter, M. Jaskolski , Humana Press, 2017; DOI: 10.1007/978-1-4939-7000-1
B. RUPP - Biomacromolecular crystallography: principles, practice and applications to structural biology. Abingdon, New York: Garland Science, Taylor & Francis Group, 2010.
Li-Ling Ooi - Principles of X-ray Crystallography, , Oxford university press, 2010
McPHERSON - Introduction to macromolecular crystallography, Wiley-Liss, 2003
A. McPherson: Introduction to Macromolecular Crystallography, Wiley-Liss, Hoboken, New
Jersey 2003
D. Blow - Outline of crystallography for biologist, Oxford university press, 2002
A.M. Lesk: Introduction to protein architecture, Oxford University Press, Oxford 2001.
Practical Protein Crystallography, D.E. McRee: Practical Protein Crystallography, 2nd Edition, Academic Press, 1999.
- DOPUNSKA LITERATURA:
revijalni članci i znanstvene monografije
|
Pristupačnost
