Repozitorij

Repozitorij je prazan

Anketa

Na ovoj stranici trenutno nije odabrana niti jedna anketa!

Proteinska kristalografija

Šifra: 60219
ECTS: 6.0
Nositelji: doc. dr. sc. Ivana Kekez
Izvođači: doc. dr. sc. Ivana Kekez - Vježbe u praktikumu

doc. dr. sc. Ivana Kekez - Seminar
Prijava ispita: Studomat
Engleski jezik:

0,0,0

Nastavnik nije u mogućnosti ponuditi nastavu na engleskom jeziku.
Opterećenje:

1. komponenta

Vrsta nastaveUkupno
Predavanja 30
Vježbe u praktikumu 15
Seminar 15
* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)
Opis predmeta:
ISHODI UČENJA:
1. Objasnitii fizikalne temelje difrakcije na kristalu.
2. Objasniti metode određivanja kristalne strukture proteina.
3. Izvesti eksperiment kristalizacije proteina.
4. Primijeniti osnovne metode rješavanja i utočnjavanja struktura proteina.
5. Koristiti se bazama riješenih struktura bioloških makromolekula.

PREDAVANJA:
1. Makroskopska svojstva kristala.
2. Osnove simetrije u kristalima; Millerovi indeksi, točkine grupe.
3. Kristalne rešetke.
4. Prostorne grupe.
5. Osnovni principi difrakcije na monokristalima; Braggov zakon
6. Metode kristalizacije proteina.
7. Izvori i detektori rentgenskog zračenja.
8. Fourierova sinteza; problem faza.
9. Metode sakupljanja difrakcijskih podataka.
10. Proteinske baze podataka.
11. Osnovne metode određivanja kristalne strukture proteina.
12. Izrada modela i utočnjavanje strukture
13. Analiza riješene strukture.

SEMINAR:
Samostalno rješavanje, utočnjavanje, analiziranje i vizualizacija dodijeljene strukture biološke makromolekule i prezentiranje rješenja.

VJEŽBE:
1. Kristalizacija odabranog proteina metodom difuzije para u visećoj kapi.
2. Odabir kristala i sakupljanje difrakcijskih podataka.
3. Procesiranje podataka i rješavanje kristalne strukture odabrane biološke makromolekule korištenjem metode molekulske zamjene.
4. Utočnjavanje kristalne strukture odabrane biološke makromolekule.
5. Analiza i vizualizacija strukture odabrane biološke makromolekule.
Literatura:
3. semestar
Izborni predmeti - Strukturna biologija - Redovni Studij - Molekularna biologija
Termini konzultacija:

Obavijesti